面对工伤有劳动合同但单位不承认的情况，职工应积极收集证据，通过法律途径维护自己的合法权益。以下是具体的分析和建议：
一、明确单位不认可的原因
首先，与单位负责人员沟通，明确其对工伤认定不认可的具体理由。常见原因可能包括对事故发生经过的异议、对受伤时间地点的争议，或质疑受伤程度等。了解这些原因有助于你针对性地收集和补充证据。
二、全面收集和补充证据
证明劳动关系的证据：
- 既然已有劳动合同，这是最直接有力的证据。同时，还可以收集工资支付记录（如工资条、银行流水）、工作证、考勤记录等，以进一步证明劳动关系的存在。
证明工伤事实的证据：
- 收集事故现场证人证言，尤其是无利害关系的证人，并留下联系方式以便后续调查。
- 医院诊断证明、病历、检查报告等，详细记录受伤和治疗情况。
- 事故现场照片、视频，特别是监控录像，以及工作相关的出行记录等，以证明受伤时正在履行工作职责。
三、申请工伤认定
- 单位申请：单位应在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起30日内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未按时申请，职工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内直接向社会保险行政部门提出申请。
- 提交材料：包括《工伤认定申请表》、劳动关系证明材料（如劳动合同）、医疗机构出具的受伤后诊断证明书或职业病诊断证明书，以及其他能证明事故发生经过和原因的材料（如事故现场照片、视频、证人证言等）。
- 配合调查：社会保险行政部门受理申请后，会进行调查核实。职工应积极配合，提供必要的证据和说明。只要事实清楚、证据确凿，即使单位不承认，也会认定为工伤。
四、申请劳动仲裁确定劳动关系（如需）
若单位不认可劳动关系存在，且你无法提供足够的证据证明劳动关系，可向劳动仲裁机构申请仲裁。提供充分证据证明劳动关系后，仲裁机构将作出公正裁决。劳动关系确认后，再向劳动保障行政部门申请工伤认定。
五、依法申请行政复议或提起行政诉讼
- 行政复议：若对工伤认定决定不服，单位或职工均可在收到决定书之日起60日内向上一级行政部门或同级人民政府申请行政复议。对复议结果不服，可在收到复议决定书之日起15日内向人民法院提起行政诉讼。
- 行政诉讼：职工对工伤认定决定不服，同样可在收到决定书之日起6个月内直接向人民法院提起行政诉讼。法院会对工伤认定的合法性、关联性、真实性进行审查，并作出公正判决。
六、后续处理与法律帮助
- 继续收集证据：即使单位不配合，职工也应持续收集能证明工伤的证据。
- 提起劳动仲裁或诉讼：工伤认定完成后，若单位仍不承担工伤赔偿责任，职工可依法提起劳动仲裁或向法院提起诉讼。
- 寻求法律帮助：在整个过程中，如遇困难，应向我咨询，以获取准确的法律建议和有效的法律支持。
总结来说，面对工伤有劳动合同但单位不承认的情况，职工应保持冷静，积极准备证据并按照法定程序申请工伤认定。若遭遇阻碍，可通过劳动仲裁、法律诉讼等途径维护自己的合法权益。 有问题可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细、准确的法律指导。