公司使用员工身份证进行税务申报是合法的，但前提是必须依法使用并确保信息安全。以下是详细分析：
一. 合法使用情况
代扣代缴个人所得税：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》，公司作为扣缴义务人，在向员工支付工资、薪金等所得时，有责任代扣代缴个人所得税。这一过程中，公司需要使用员工的身份证信息以确保税务申报的准确性。
- 实例：公司每月发放工资时，会根据员工的收入情况代扣个人所得税，并上报税务机关，这是合法的税务操作流程。
如实报送税务信息：
- 依据《中华人民共和国税收征收管理法》，纳税人和扣缴义务人在办理纳税申报时，必须如实报送相关信息。员工的身份证号码是税务申报的一部分，用于确认纳税人的身份和税务记录。
- 实例：公司在年度税务申报时，需要提交包括员工身份证信息在内的各种税务资料，以确保申报的合规性和准确性。
二. 不合法使用情况
- 如果公司未经员工同意或授权，擅自使用员工身份证信息进行虚假报税或用于其他非法目的，如虚增成本、套取资金等，则是违法的。这种行为不仅损害了员工的利益，也可能导致公司面临税务机关的处罚。
三. 注意事项与数据安全
- 公司在使用员工身份证信息时，必须确保信息的准确性和安全性，防止信息泄露或被不法分子利用。
- 公司应建立完善的内部管理制度，规范员工信息的使用和存储，以确保数据的安全和隐私。
综上所述，公司使用员工身份证进行税务申报是合法的，但前提是必须依法使用，并确保员工信息的安全和隐私。如有进一步需要，您可以继续咨询我。