课题主持人辞职后，通常不能单方面不同意变更主持人。以下是详细分析：

一. 课题主持人的辞职影响

1. 职责终止：课题主持人辞职意味着其将不再承担该课题的主持职责，相应的权利和义务也随之终止。
2. 项目连续性：为了确保课题的顺利进行和项目的连续性，通常需要对主持人进行变更。

二. 变更主持人的法律依据

1. 合同约定：大多数课题项目都会签订相关的合同或协议，其中会明确课题主持人的职责、权利以及变更主持人的相关条款。如果合同中有明确规定在主持人辞职后可以变更主持人的条款，那么主持人就不能单方面不同意变更。
2. 组织规定：课题通常隶属于某个组织或机构，该组织或机构会有相应的管理规定或章程。这些规定中往往会明确课题主持人的变更程序和条件，主持人需遵守相关规定。

三. 变更主持人的实际操作

1. 协商与沟通：在主持人辞职后，相关组织或机构通常会与主持人进行沟通，协商变更主持人的事宜。
2. 正式程序：变更主持人通常需要经过一定的正式程序，如提名新主持人、征求相关方意见、审批等。

综上所述，课题主持人在辞职后，由于职责的终止和项目连续性的需要，通常不能单方面不同意变更主持人。我建议主持人应理性对待变更事宜，积极配合相关组织或机构完成主持人的变更工作，以确保课题的顺利进行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。