轻微擦伤后肇事逃逸，双方达成和解协议，仍然可能会被处罚。这是因为交通肇事逃逸本身就是一种违法行为，它不仅损害了受害者的权益，还破坏了正常的交通管理秩序。下面我详细解释一下：

一、交通肇事逃逸的性质与后果

交通肇事逃逸，即在发生交通事故后，驾驶员未立即停车、保护现场、抢救受伤人员或报警，而是选择逃离现场。这种行为不仅违反了《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，还可能导致严重的法律后果。

二、处罚的法律依据

根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条的规定，对于造成交通事故后逃逸但尚不构成犯罪的，公安机关交通管理部门可以处以二百元以上二千元以下罚款，并可并处十五日以下拘留。同时，逃逸行为还会导致驾驶证被扣分，甚至可能被吊销驾驶证。

三、和解与处罚的关系

双方就民事赔偿部分达成和解，并不能免除逃逸者应承担的法律责任。和解主要解决的是双方之间的财产损失等纠纷，而逃逸行为的法律后果是由交通管理部门依据相关法律法规来处理的。因此，即使双方达成了和解协议，交警部门仍然有权对逃逸行为进行处罚。

四、实际案例与启示

在实际案例中，不乏因轻微擦伤后肇事逃逸而被处罚的例子。这些案例告诉我们，无论事故多么轻微，都不能选择逃逸。逃逸不仅不能解决问题，反而会让问题变得更加复杂，甚至可能面临更严重的法律后果。

五、建议与总结

因此，我建议大家在发生交通事故后，无论事故大小，都应该立即停车、保护现场、抢救受伤人员并报警。这样不仅可以保护自己的合法权益，还可以避免不必要的法律纠纷和后果。

综上所述，轻微擦伤后肇事逃逸，即使双方达成了和解协议，仍然可能会被处罚。希望大家能够遵守交通法规，文明驾驶，共同维护良好的交通秩序。