在劳动仲裁期间，如果公司恶意销毁证据，这不仅违反了相关法律法规，也严重损害了员工的合法权益。针对这种情况，您可以采取以下措施来维护自己的权益：

首先，要明确公司销毁证据是违法行为。如果您能证明公司有销毁行为，并且这些证据对于维护您的权益至关重要，比如涉及劳动纠纷、工伤认定等案件的关键证据，那么您就有权采取进一步的行动。

其次，您可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门是负责监督企业遵守劳动法律法规的机构，他们有权对公司进行调查，并责令其改正错误，采取补救措施，以尽力弥补您可能受到的损失。在投诉时，请提供尽可能详细的证据和情况说明，以便劳动监察部门能够更好地了解您的问题并采取相应的行动。

另外，您还可以通过劳动仲裁或诉讼途径来解决纠纷。在仲裁或诉讼过程中，您可以向仲裁委或法院申请调查取证，详细说明证据被公司销毁的情况。仲裁委或法院会根据案件事实及其他相关证据进行综合判断，并作出公正的裁决。如果因为公司销毁证据导致您的权益受损，您有权要求公司承担相应的赔偿责任，包括经济损失、精神损害赔偿等。

最后，需要强调的是，如果公司恶意销毁证据的行为构成犯罪，比如拒不执行判决、裁定罪等，那么公司和相关责任人员都将受到法律的制裁。具体的定罪量刑需要由司法机关结合案件实际情况进行判定。

总之，面对公司恶意销毁证据的情况，您应该保持冷静，采取合适的措施来维护自己的权益。同时，也要相信法律的力量，相信公正和正义一定会得到彰显。