市交通局不能按招投标法处罚违法分包建筑企业。下面是对此问题的详细分析：

一. 核心法规适用性分析

1. 招投标法的适用范围：招投标法主要规范的是工程建设项目的招标投标活动，对于招标投标过程中的违法行为，如串通投标、弄虚作假等，招投标法有明确的处罚规定。

2. 违法分包行为的法规依据：根据提供的案例，违法分包行为是依据《建设工程质量管理条例》第二十五条第三款进行处罚的，而非招投标法。这表明，对于违法分包行为，其性质更偏向于工程质量管理的范畴，而非招标投标活动的范畴。

3. 市交通局的处罚依据：在案例中，市交通局对违法分包行为进行了处罚，其依据是《建设工程质量管理条例》，而非招投标法。这进一步证明了市交通局在处理此类违法行为时，是依据工程质量管理的相关法规，而非招标投标法规。

二. 实际案例分析

• 以贵州建工集团第六建筑工程有限公司将承包的工程转包案为例，市交通局在发现其违法分包行为后，是依据《建设工程质量管理条例》进行了处罚，而非招投标法。这说明了在实际操作中，市交通局对于违法分包行为的处理是遵循工程质量管理的相关法规的。

综上所述，市交通局在处理违法分包行为时，是依据《建设工程质量管理条例》等工程质量管理的相关法规，而非招投标法。因此，市交通局不能按招投标法处罚违法分包建筑企业。如有进一步需要，您可以继续咨询我。