部门经理13年的员工开除是否有赔偿，取决于开除的具体原因和情况。以下是根据不同情况的具体分析：

1. 合法辞退无需赔偿：

   • 当员工出现严重违反公司规章制度等《劳动合同法》第三十九条规定的情形时，公司进行辞退属于合法行为，这种情况下公司无需向员工支付赔偿。

2. 合法解除需支付经济补偿：

   • 如果公司是依据《劳动合同法》第四十条、四十一条的规定合法与员工解除劳动合同（如员工不能胜任工作，经培训或调岗仍不行，或单位经济性裁员等），就需要支付经济补偿。
   • 经济补偿按照员工在本单位的工作年限来计算，每满一年支付一个月工资。对于有13年工龄的员工，公司应支付13个月工资作为经济补偿。这里的月工资是指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

3. 违法辞退需支付赔偿金：

   • 要是公司属于违法辞退员工，就需要按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。也就是说，公司要支付给员工26个月的工资。

综上所述，部门经理13年的员工开除是否有赔偿，关键在于辞退的原因和是否符合法律规定。如果公司合法辞退，可能无需赔偿或需支付经济补偿；如果公司违法辞退，则需支付高额赔偿金。如有具体法律问题或需要进一步咨询，请直接向我提问。