国有独资企业副总兼任子公司法人和经理职务被告知不能兼任并被处分，这一处理并不一定合理。具体分析如下：
法规依据
首先，我们需要明确的是，国有独资企业副总兼任子公司法人和经理职务的合法性，主要取决于相关的法律法规以及企业内部的规定。根据《中华人民共和国公司法》以及《中华人民共和国企业国有资产法》等相关法律法规，并未明确禁止国有独资企业的副总兼任子公司的法人和经理职务。
分析角度
法律法规层面：
- 如前所述，相关法律法规并未明确禁止此类兼任行为。因此，从法律层面来看，仅因兼任行为本身而对其进行处分可能缺乏法律依据。
企业内部规定层面：
- 国有独资企业可能根据其自身的经营管理和组织架构需要，制定有相应的内部规定或管理制度。这些规定可能涉及高管人员的兼职、任职回避等事项。
- 如果企业内部确有此类规定，并且副总兼任子公司法人和经理职务违反了这些规定，那么企业依据内部规定对其进行处分可能是合理的。
实际运营考虑：
- 兼任行为是否影响企业的正常运营和管理效率也是一个需要考虑的因素。如果兼任导致管理混乱、决策冲突或利益输送等问题，那么企业出于维护自身利益的考虑，对兼任行为进行规范或处分也是合理的。
结论与建议
综上所述，国有独资企业副总兼任子公司法人和经理职务被告知不能兼任并被处分，其合理性取决于具体的法律法规、企业内部规定以及实际运营情况。如果仅因兼任行为本身而缺乏明确的法律依据或违反企业内部规定，那么该处分可能并不合理。
建议相关当事人或企业：
- 仔细审查相关的法律法规和企业内部规定，明确兼任行为的合法性和合规性。
- 如果确实存在违规或不合法的兼任行为，应积极配合企业的整改要求，进行相应的调整。
- 如果认为处分决定不合理或存在争议，可以通过合法的途径进行申诉或寻求法律援助。
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