请假工资应该从底薪里扣还是实际工资，需根据具体情况及公司规定判断，但通常不得违反法律法规。以下是详细分析：
一. 一般情况
按底薪计算：
- 在很多公司的实际操作中，请假扣工资确实是依据底薪进行的。底薪作为员工的基本固定收入，能够较为准确地反映员工的基本劳动价值，且以此为基数计算扣薪，操作相对简便，也便于企业的管理与财务核算。
- 例如，某员工的月薪由底薪3000元和绩效奖金2000元组成，若其请假一天，公司可能会按照底薪3000元的标准来扣除相应工资。
按实际工资计算：
- 在某些特殊薪酬制度或行业（如销售岗位）中，由于员工的收入主要来源于业绩提成或奖金，因此请假时可能会按照实际工资（包括底薪、提成、奖金等）来计算扣款，特别是当请假直接影响到员工的业绩提成时。
- 例如，某销售员工的月薪由底薪1500元和业绩提成组成，若其请假导致业绩下滑，公司可能会按照实际工资（底薪+提成）的标准来扣除相应工资。
二. 特殊情况与合同约定
公司规章制度：
- 若公司规章制度中明确规定了请假扣工资的计算方式（按底薪或实际工资），且该规定不违反法律法规，则公司应按照此规定执行。
劳动合同约定：
- 劳动合同是员工与公司之间的重要约定，其中可能包含关于请假扣工资的具体条款。若劳动合同中有明确约定，则应遵循合同约定执行。
- 若劳动合同中的约定模糊或有争议，双方应首先进行协商解决；协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
三. 法律法规依据
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，工资分配应遵循按劳分配原则，实行同工同酬。用人单位有权依法自主确定工资分配方式和水平，但需在遵守法律法规的前提下制定扣款规定。
- 同时，无论按照底薪还是实际工资扣除，扣除后的工资均不得低于当地最低工资标准，以保障劳动者的基本生活需要。
四. 实践建议
- 了解政策：员工在请假前应详细了解公司的请假扣工资政策，并在签订劳动合同时仔细审查相关条款。
- 沟通询问：若对扣薪方式有疑问或认为不合理，应及时与公司的人力资源部门沟通，明确公司规定和计算方法。
- 合法维权：若认为公司的扣薪行为违法或违反劳动合同约定，可以向当地劳动行政管理部门投诉举报，寻求合法解决方案。
综上所述，请假工资应该从底薪里扣还是实际工资，并没有固定的答案。它取决于公司的规章制度、劳动合同的约定以及当地的法律法规。在任何情况下，扣除后的工资都不得低于当地最低工资标准，且扣薪方式应公平合理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。