员工偷偷把合同改了是违法的。合同是双方自愿达成的具有法律效力的契约，一旦签署，就意味着双方都需要严格遵守其中的条款。如果员工在未获得另一方同意且没有法定变动理由的情况下，私自改动合同条款，这就构成了违约行为。

从法律角度来看，合同的修订应当遵循特定的程序和准则。通常情况下，合同的变更需要双方达成一致意见，并以书面形式进行确认。员工擅自变动关键条款，可能会导致整个合同失效或者部分条款失灵，从而给对方造成损失。在这种情况下，员工不仅需要承担违约责任，还可能需要赔偿因此给对方造成的损失。

具体法律后果则取决于合同的性质、所改条款的重要性以及改动所产生的影响。因此，我建议员工在面临合同问题时，应当寻求合法合规的途径进行解决，而不是私自改动合同条款。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。