结论前置：中标单位项目经理有在建项目是否会导致废标，主要取决于招标文件的具体规定、相关法律法规的约束以及项目合同的约定。若招标文件或相关法律法规明确禁止，且该在建项目影响本项目合同的履行，则可能导致废标。

详细分析：

1. 招标文件的规定：

   • 明确禁止：如果招标文件明确规定，参与投标的项目经理不得有在建工程，那么在中标后发现项目经理有在建项目，将构成对招标文件的重大偏离，招标人有权取消该投标人的中标资格。
   • 未明确禁止但影响合同履行：即便招标文件未明确禁止，但若项目经理的在建项目可能严重影响本项目合同的履行，如时间冲突、精力分散等，招标人在经过合法合规的调查后，仍有可能决定取消其中标资格。

2. 法律法规的约束：

   • 《注册建造师管理规定》等相关法规规定，注册建造师不得同时在两个及两个以上的建设工程项目上担任施工单位项目负责人。因此，若项目经理违反此规定，在中标后有在建项目，将可能面临法律责任，进而影响中标资格。

3. 项目合同的约定：

   • 招标人常在资格审查要求中明确“项目经理无在建工程”，并要求提供相应证明。投标人响应此要求并在投标文件中承诺项目经理无在建项目，若中标后发现不实，招标人有权根据招标文件和合同约定取消其中标资格。

4. 实际操作中的考量：

   • 在实际操作中，招标人会严格审查投标人的资格条件，包括项目经理的在建情况。若发现项目经理有在建项目且违反招标文件或相关法律法规，招标人会启动废标流程，并可能重新招标。

总结与建议：

• 对于投标人而言，应严格遵守招标文件和相关法律法规的要求，确保项目经理无在建项目，以降低废标风险。
• 对于招标人而言，应合理设定招标条件，明确项目经理的在建项目要求，并在招标文件中明确说明。同时，应加强资格审查力度，确保招标的公平、公正和顺利进行。
• 若您在实际操作中遇到此类问题，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。