针对你提出的问题，即公司提起二审，理由是一审判决一次性付清奖金没有扣除个人所得税，以下是我的详细解答：

结论：公司提起二审的理由可能涉及税法与劳动法的相关规定，但一审判决是否应扣除个人所得税需根据具体情况分析。

分析：

1. 税法规定：根据《中华人民共和国个人所得税法》及相关规定，个人取得的所得（包括奖金）应依法缴纳个人所得税。因此，如果一审判决的奖金属于个人所得，且金额达到纳税标准，那么理论上应当扣除相应的个人所得税。

2. 劳动法规定：在劳动关系中，奖金通常作为劳动报酬的一部分。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有义务代扣代缴员工应缴纳的个人所得税。因此，如果一审判决的奖金是员工劳动报酬的一部分，且用人单位在发放时未代扣代缴个人所得税，那么用人单位在二审中提出扣除个人所得税的请求是有一定法律依据的。

3. 具体情况分析：

   • 如果一审判决的奖金已经明确是税后金额，或者在一审过程中已经考虑了个人所得税的扣除，那么公司在二审中提出扣除个人所得税的请求可能不会被支持。
   • 如果一审判决的奖金是税前金额，且用人单位在发放时未代扣代缴个人所得税，那么公司在二审中提出扣除个人所得税的请求可能会得到支持。

4. 法律建议：

   • 对于公司而言，如果确实存在未代扣代缴个人所得税的情况，应当在二审中提供充分的证据来证明这一点，并请求法院对一审判决进行相应的调整。
   • 对于员工而言，如果认为公司已经代扣代缴了个人所得税或者一审判决的奖金已经是税后金额，应当在二审中积极应诉并提供相应的证据来支持自己的主张。

综上所述，公司提起二审的理由涉及税法与劳动法的相关规定，但一审判决是否应扣除个人所得税需根据具体情况分析。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。