项目经理资质与承包资质不符，将可能导致合同无效、项目停工、信用分扣除，甚至可能面临行政处罚。具体分析如下：

一. 合同效力问题

1. 建设施工合同的特殊性：根据相关法律法规，建设施工合同的承包人必须是具备相应资质的法人主体。如果项目经理的资质与承包资质不符，可能意味着承包方不具备履行合同的能力，这将直接影响合同的效力。
2. 法律后果：一旦合同被认定为无效，双方将失去合同约定的权利和义务，可能导致工程停工、资金损失等一系列严重后果。

二. 项目停工与信用分扣除

1. 停工整改：根据某些地区的住房城乡建设主管部门的规定，如果项目经理或总监理工程师的资质不符合要求，施工总承包单位或监理单位将被要求停工整改。例如，在某些地区，若项目经理为非注册建造师，将要求停工并扣除信用分。
2. 信用分扣除：信用分对于施工企业的市场准入和业务发展至关重要。一旦因资质不符被扣除信用分，将严重影响企业的市场声誉和竞争力。

三. 行政处罚

1. 法律依据：根据《中华人民共和国行政许可法》及相关建筑业企业资质管理规定，利用虚假材料、以欺骗手段取得资质的行为将受到严厉的行政处罚。这包括撤销行政许可、罚款、禁止再次申请行政许可等。
2. 实际案例：以安徽省住房和城乡建设厅的撤销行政许可决定书为例，因项目经理信息不实，导致企业建筑工程施工总承包二级资质被撤销，且自撤销之日起3年内不得再次申请该项行政许可。

综上所述，项目经理资质与承包资质不符将带来严重的法律后果。因此，我建议企业在签订建设施工合同时，务必确保项目经理的资质与承包资质相符，以避免潜在的法律风险和经济损失。同时，企业也应加强内部管理，确保所有资质的真实性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。