事业编交通肇事罪被判有期徒刑三年缓刑三年，不一定会被开除。具体是否会被开除，需要根据《事业单位工作人员处分暂行规定》以及单位内部的相关规定来确定。

1. 法律规定：

   • 根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第二十二条，事业单位工作人员被依法判处刑罚的，给予降低岗位等级或者撤职以上处分。其中，被依法判处有期徒刑以上刑罚的，给予开除处分。但此处需注意的是，该条款并未明确说明缓刑是否属于“有期徒刑以上刑罚”。

2. 缓刑的特殊性：

   • 缓刑是刑法上的一种刑罚执行方式，它并不直接执行有期徒刑，而是在一定的考验期内，如果犯罪人没有再犯罪，则原判的刑罚就不再执行。因此，从某种程度上讲，缓刑的处罚程度要轻于直接执行的有期徒刑。

3. 单位内部规定：

   • 除了法律规定外，单位内部也可能有针对此类情况的具体规定。这些规定可能因单位性质、行业特点等因素而有所不同。因此，在具体判断时，还需要参考单位内部的相关规定。

4. 综合考量：

   • 在决定是否开除时，单位通常会综合考虑多种因素，如犯罪人的平时表现、犯罪情节、社会影响等。如果犯罪人平时表现良好，犯罪情节较轻，且社会影响不大，那么单位可能会倾向于给予较轻的处分，如降低岗位等级或撤职，而不是直接开除。

综上所述，事业编交通肇事罪被判有期徒刑三年缓刑三年，并不一定会被开除。具体结果需要根据法律规定、单位内部规定以及案件的具体情况来综合判断。如果你对此有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。