对方公司只代表与总承包方代收款并同步收取管理费是否合法，取决于具体的合同条款和法律规定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同条款的约定：

   • 首先，需要查看双方签订的合同中是否有关于代收款和管理费收取的明确条款。
   • 如果合同中明确规定了对方公司有权代表总承包方代收款，并同时收取一定比例的管理费，且该约定不违反相关法律法规的强制性规定，那么这种收费是合法的。

2. 法律规定的考量：

   • 根据相关法律法规，如《中华人民共和国合同法》等，合同双方应遵循平等、自愿、公平和诚实信用的原则。
   • 如果对方公司在没有合同依据或法律依据的情况下，擅自收取管理费，则可能构成不当得利或违约行为，此时收费是不合法的。

3. 实际情况的判断：

   • 需要具体了解对方公司收取管理费的依据、标准以及是否提供了相应的管理服务。
   • 如果对方公司仅仅是以代收款为名，实际上并未提供任何管理服务，或者收取的管理费过高，与提供的服务不相匹配，那么这种收费可能存在问题。

4. 建议与措施：

   • 如果你对对方公司的收费行为存在疑问，建议首先查阅双方签订的合同，明确合同中的权利义务关系。
   • 如果合同中没有明确规定或规定不明确，可以与对方公司进行协商，要求对方提供收费的依据和明细。
   • 如果协商无果，且你认为对方公司的收费行为不合法，可以寻求法律途径维护自己的权益，如向法院提起诉讼或向相关监管部门投诉。

综上所述，对方公司只代表与总承包方代收款并同步收取管理费是否合法，需要根据具体的合同条款和法律规定来判断。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。