虚开增值税专用发票罪中冲红的发票不应认定在虚开的数额里。具体分析如下：
一. 虚开增值税专用发票罪的认定要点
真实交易的存在：在石化行业中，如果整个链条中存在真实的货物交易，并且开具的增值税专用发票的数量和金额符合实际交易情况，则不构成虚开行为。即使上游企业冲红了发票，但只要下游企业基于真实的货物交易进行了库存额度的增加，并且按照实际交易情况开具了发票，上游企业的行为就不构成虚开增值税专用发票罪。
行为人主观目的：如果行为人主观上并无骗取的扣税款的故意，客观上未造成国家增值税款损失的，不宜以虚开增值税专用发票罪论处。即使上游企业冲红了发票，但如果其主观上没有骗取税款的目的，且客观上没有造成国家税收损失，那么其行为也不构成虚开增值税专用发票罪。
骗取抵扣增值税的目的和危险性：如果行为人实施了虚开行为，但没有“骗取抵扣增值税”的目的和危险性，那么也不构成虚开增值税专用发票罪。即使上游企业冲红了发票，但如果其行为并没有导致国家增值税损失，或者没有给国家税收带来风险，那么其行为也不构成虚开增值税专用发票罪。
虚开增值税专用发票罪的构成要件：根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票的行为主要包括没有货物购销或者没有提供或接受应税劳务而为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具增值税专用发票，或者是有货物购销或者提供或接受了应税劳务但为他人、为自己、让他人为自己、介绍他人开具数量或者金额不实的增值税专用发票。如果上游企业的行为不符合这些情形，那么其行为就不构成虚开增值税专用发票罪。
二. 冲红发票的处理
冲红发票是税务上的一种操作，通常用于纠正之前开具的错误发票。如果上游企业冲红了发票，但整个交易链条是真实的，且没有造成国家税收损失，那么这种行为就不应被视为虚开增值税专用发票。因此，冲红的发票不应被计入虚开的数额里。
综上所述，在虚开增值税专用发票罪中，冲红的发票不应被认定在虚开的数额里。这是因为冲红发票本身是一种纠正错误发票的行为，如果整个交易链条是真实的，且没有造成国家税收损失，那么这种行为就不构成虚开增值税专用发票罪。我的观点是，对于冲红发票的处理，应结合实际交易情况和行为人的主观目的进行综合分析，以确保法律的公正和合理适用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。