学校开除学生，如果未经法定程序或缺乏合理合法的依据，会侵犯学生的多项权利。具体来说：
受教育权：受教育权是公民的基本权利之一，受我国宪法、教育法以及《中华人民共和国义务教育法》等多部法律的保护。学校擅自开除学生，直接破坏了学生正常的学业进程，阻碍了学生通过教育提升自身素质、追求个人发展的可能，这是对学生受教育权的严重侵犯。
平等权：学生在接受教育过程中应享有平等的受教育机会。学校若擅自开除学生，且缺乏合理合法的依据，将构成对学生平等权的侵害，使得被开除的学生无法在学校中平等地接受教育，违背了教育公平的原则。
人格尊严权：学校在开除学生的过程中，必须尊重学生的人格尊严。若学校在擅自开除学生时，采用了不恰当、不尊重的方式，如公开羞辱等，将严重侵犯学生的人格尊严权。
申诉权、辩护权等程序性权利：根据相关法律法规，学生在面对可能被处分（包括开除）的情况时，依法享有申诉、为自己辩护等程序性权利。学校擅自开除学生，往往意味着没有给予学生陈述情况、为自己辩解的机会，也没有按照规定的程序让学生行使申诉权利，这严重侵害了学生应有的程序性权利。
综上所述，学校擅自开除学生是一种严重的违法行为，不仅违反了相关法律法规，更侵犯了学生的多项合法权益。因此，学校在处理学生问题时，必须严格遵循法定程序，确保学生的各项权利得到充分保障。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。