一些公司规定不能发合同的原因，主要是为了避免签订或发放那些可能违反法律法规、损害他人利益、以合法形式掩盖非法目的，或是超出经营范围且违反国家限制规定的合同。以下是具体的分析：
避免签订违法合同：
- 公司必须确保所签订的合同不违反法律法规的强制性规定。例如，不能与员工约定工伤不赔偿的条款，或未取得相应资质而签订建设工程施工合同。这类合同根据《中华人民共和国民法典》的相关规定是无效的，且可能导致公司承担法律责任。
保护公司及他人利益：
- 公司应避免签订那些可能损害国家、集体或第三人利益的合同。如恶意串通压低价格以谋取私利，这类行为不仅损害他人利益，还可能触犯刑法。
防止以合法形式掩盖非法目的：
- 有些合同表面看似合法，实则掩盖了非法的目的，如为逃避执行而签订的虚假房屋买卖合同。这类合同通常被认定为无效，且当事人需承担相应法律责任。
遵守国家限制经营和特许经营规定：
- 公司应确保所签订的合同不超出其经营范围，且不违反国家关于限制经营或特许经营的规定。例如，未经许可销售烟草或医疗器械是违法的，相关合同也将被视为无效。
此外，公司还需谨慎对待以下几类合同：
- 无效合同：如与无签约资格的主体签订的合同，可能被视为无效。
- 存在重大风险的合同：权利义务不对等或条款模糊不清的合同，可能引发纠纷并给公司带来损失。
- 损害公司利益的合同：如显失公平或存在欺诈、胁迫的合同，公司应坚决避免签订。
综上所述，公司规定不能发合同，是为了确保合同的合法性、有效性和公平性，保护公司及他人的合法权益，降低法律风险。因此，公司在签订合同时应严格遵守法律法规，进行全面审查，并咨询专业法律人士以降低法律风险。