针对您提出的“职务侵占5000万，但含公司费用怎么办”的问题，首先我们需要明确的是，职务侵占是一种严重的犯罪行为，无论侵占的金额中是否包含公司费用，都不能成为减轻或免除刑事责任的理由。以下是我对这个问题的具体分析：

1. 明确职务侵占的定义与性质：

   • 职务侵占是指公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。
   • 这是一个明确的刑事犯罪行为，其性质严重，不仅损害了公司的利益，也破坏了社会的经济秩序。

2. 区分公司费用与个人侵占：

   • 虽然您提到侵占的金额中包含公司费用，但这并不改变职务侵占的本质。
   • 公司费用应当是公司正常运营所必需的支出，而职务侵占则是将这些费用或个人应得的报酬以外的公司财物非法占为己有。

3. 法律后果与责任承担：

   • 职务侵占数额巨大的（如您所述的5000万），将面临严厉的刑事处罚，包括但不限于有期徒刑、罚金等。
   • 同时，侵占者还需要承担民事赔偿责任，向公司返还被侵占的财物或赔偿相应的损失。

4. 建议与行动：

   • 如果您或您所知的人涉及此类情况，建议立即停止侵占行为，并主动向公司说明情况，争取从轻或减轻处理。
   • 同时，也可以考虑寻求专业的法律帮助，了解具体的法律后果和应对策略。

5. 特别提醒：

   • 职务侵占行为不仅损害公司利益，也严重影响个人的声誉和未来职业发展。
   • 请务必遵守法律法规，诚信履职，避免触碰法律红线。

综上所述，职务侵占是一种严重的犯罪行为，无论侵占的金额中是否包含公司费用，都不能成为减轻或免除刑事责任的理由。建议您或您所知的人立即停止侵占行为，并寻求专业的法律帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。