保密规章由国家保密行政管理部门制定，而国家秘密标准则由国家标准化行政主管部门制定。具体分析如下：

一. 保密规章的制定

1. 制定主体：根据《中华人民共和国保守国家秘密法》第五条，国家保密行政管理部门主管全国的保密工作，因此，保密规章主要由国家保密行政管理部门负责制定。
2. 规章内容：保密规章通常涉及国家秘密的界定、保密措施、保密责任等方面的内容，是确保国家秘密安全的重要法规依据。

二. 国家秘密标准的制定

1. 制定主体：依据《中华人民共和国标准化法》第六条，国家标准化行政主管部门负责管理全国标准化工作，因此，国家秘密标准由国家标准化行政主管部门负责制定。
2. 标准内容：国家秘密标准通常包括国家秘密的密级、保密期限、知悉范围等具体标准，是判断某项信息是否属于国家秘密以及确定其密级和保密措施的重要依据。

综上所述，保密规章由国家保密行政管理部门制定，而国家秘密标准则由国家标准化行政主管部门制定。两者在保密工作中各自发挥着重要的作用，共同维护着国家秘密的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。