员工在单位死亡三年多才被发现，公司可能需要承担的责任主要取决于员工死亡的具体原因、公司是否存在过错或违法行为，以及相关的法律法规。以下是从几个不同角度进行的分析：

1. 工伤认定与赔偿：

   • 如果员工的死亡被认定为工伤，公司需要按照《工伤保险条例》的规定，支付工伤赔偿金，包括丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金等。
   • 工伤的认定通常需要考虑员工是否在工作时间和工作场所内，或者因工作原因受到事故伤害或患职业病。由于员工死亡时间较长，且未及时发现，这可能会给工伤认定带来一定困难。因此，需要具体分析员工死亡的具体情况，以及公司是否存在管理上的疏忽或过错。

2. 公司过错责任：

   • 如果公司存在管理上的疏忽或过错，导致员工死亡后长时间未被发现，公司可能需要承担过错责任。例如，公司未建立有效的安全管理制度、未及时发现和处理员工的异常情况等。
   • 在这种情况下，公司可能需要向员工的家属支付赔偿金，以弥补其因员工死亡而遭受的损失。

3. 侵权责任：

   • 如果员工的死亡是由于公司的侵权行为导致的，如公司提供的工作环境存在安全隐患、设备故障等，公司可能需要承担侵权责任。
   • 侵权责任的大小取决于公司侵权行为的性质、情节和后果，以及员工家属因此遭受的损失。

4. 法律程序与证据：

   • 由于员工死亡时间较长，且未及时发现，这可能会给法律程序带来一定困难。因此，需要尽快收集相关证据，如现场勘查报告、员工工作记录、公司安全管理制度等，以便进行法律分析和责任认定。
   • 同时，员工的家属也需要及时咨询专业律师，了解相关法律规定和维权途径，以便在法律程序中维护自己的合法权益。

综上所述，员工在单位死亡三年多才被发现，公司可能需要承担的责任取决于多种因素。建议员工的家属及时咨询专业律师，了解相关法律规定和维权途径，以便更好地维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。