事故双方如果属于同一个保险公司，在一般情况下，是无法进行代位追偿的。代位追偿通常适用于因第三者对保险标的造成损害而引发的保险事故，此时保险人会在赔偿后，在赔偿金额范围内代替被保险人向第三者求偿。然而，在事故双方负有同等责任的情况下，由于双方都有过错，并不存在第三者的过错导致保险事故的情形，因此不符合代位追偿的基本条件。

不过，也有一些特殊情况。比如，如果对方有故意或重大过失行为，如酒后驾车、无证驾驶等，导致你方受到损失，你方在赔偿完毕后，有权向对方追偿超出自身应承担责任的部分。此外，如果双方车辆都投保了相应的保险，如交强险和商业三者险，且满足一定条件，如对方有责任但怠于赔偿等，那么在一定范围内，如交强险的财产损失赔偿限额内，可能可以让自己的保险公司先进行赔偿，然后再由保险公司向对方追偿。

要申请代位追偿，通常需要满足以下条件：事故属于保险责任范围；对方有赔偿责任但怠于赔偿；已向自己的保险公司报案并提出索赔申请；能提供必要资料协助保险公司核实损失和行使代位追偿权。如果满足这些条件，可以向自己的保险公司提出申请，填写代位追偿申请书，并详细说明事故经过、对方责任情况等。保险公司审核通过后，会按照保险合同约定先行赔付你车辆维修等损失，之后获得向事故对方追偿的权利。

总的来说，事故双方同一个保险公司时，代位追偿的适用情况较为复杂，需要根据实际案件情况以及保险合同来确定。如果对具体操作或后续理赔细节存在疑问，建议咨询专业的保险顾问或律师以获取更详细的解答。