针对“工业用地作为商业用途出租法院会怎样判决”的问题，以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
首先，需要明确的是，工业用地作为商业用途出租是违反《土地管理法》等相关法律规定的。根据这些法律，土地的使用必须按照批准的用途进行，擅自改变土地用途是违法的。
如果发生了这样的违法行为，并且因此引发了房屋租赁纠纷，法院在审理时会考虑以下因素：
合同的有效性：法院会首先审查租赁合同的有效性。如果租赁合同本身存在违法条款，比如明确将工业用地用于商业用途，那么这份合同可能会被认定为无效。
双方的过错：在案例中，A科技公司作为土地的所有权人，理应知晓其厂房的用途有禁止性规定。而B体育公司作为承租人，在承租时也应对相关政策法规有注意义务。如果双方都在明知违法的情况下签订了合同，那么双方都有过错。
损失的分担：由于违法行为导致的合同解除和双方的经济损失，法院会根据双方的过错程度来判决损失的分担。在案例中，法院判决A科技公司与B体育公司各自承担50%的责任，即双方对装修残值损失各负担一部分。
综上所述，如果工业用地被作为商业用途出租，并且因此引发了纠纷，法院可能会判决租赁合同依法解除，并根据双方的过错程度来分担因此产生的经济损失。此外，这样的违法行为还可能面临相关部门的处罚，包括罚款、责令整改等。
因此，建议房屋租赁双方在签订合同时，务必明确土地的用途，并遵守相关法律法规，以避免不必要的法律风险和经济损失。