单位在福利分房时，通常有义务进行确权。以下是对这一结论的详细解释：

1. 确权是保障职工权益的重要环节：福利分房作为单位给予职工的一项福利，其目的在于改善职工的居住条件。确权，即确认房屋的所有权归属，是保障职工这一福利权益的关键步骤。通过确权，职工可以明确自己对所分房屋享有的权利，包括使用权、收益权以及在一定条件下的处分权。

2. 单位有义务协助完成确权手续：在福利分房的过程中，单位作为房屋的分配者，有责任和义务协助职工完成确权手续。这包括提供必要的证明文件、协助办理相关登记手续等。单位应当确保职工能够顺利取得房屋的所有权证明，从而保障职工的合法权益。

3. 确权有助于避免纠纷：明确房屋的所有权归属，可以有效避免未来可能出现的纠纷。在福利分房过程中，如果单位未履行确权义务，可能导致职工对房屋的所有权产生争议，进而引发法律纠纷。因此，单位履行确权义务，不仅是对职工权益的保障，也是维护单位自身稳定和发展的需要。

综上所述，单位在福利分房时，通常有义务进行确权，以保障职工的合法权益，避免未来可能出现的纠纷。如果单位未履行这一义务，职工可以向单位提出要求，或者寻求法律途径来维护自己的权益。