在医院与医药公司合同到期终止合同的情况下，通常需要准备以下资料：
合同原件及副本：首先需要的是双方签订的原始合同及其副本，这是了解合同条款、终止条件及双方权利义务的基础。
合同终止通知书：一方需要向另一方发出正式的合同终止通知书，明确表明终止合同的意愿，并注明终止的日期及理由（如合同到期自然终止）。
履行情况证明：包括但不限于合同履行期间的交易记录、交付凭证、验收报告等，以证明双方已按合同约定履行了各自的义务。
财务结算文件：如果合同涉及款项支付，需要提供财务结算的相关文件，如发票、付款记录、对账单等，以确保双方财务上的清晰无争议。
相关法律法规文件：根据合同性质及行业规定，可能需要查阅并准备相关的法律法规文件，以确保合同终止的合法性及合规性。
其他附件：如合同中有特别约定，可能还需要提供其他特定的附件或证明文件，如保密协议、知识产权转让协议等。
准备这些资料有助于双方顺利、合法地终止合同，并避免可能的纠纷。如果你在具体操作过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，可以随时向我咨询。