事业单位财务人员以单位名义虚开发票违规套取50万，可能会受到行政处分，甚至被追究刑事责任。具体分析如下：

一. 行政处分

1. 依据：根据《财政违法行为处罚处分条例》第十四条，企事业单位或其他组织的财务人员若有违反规定使用、骗取财政资金的行为，将会受到警告、记过或者记大过处分；情节较重的，给予降级或者撤职处分；情节严重的，给予开除处分。虚开发票违规套取资金，显然属于此类违反规定的行为。
2. 应用：在此案例中，财务人员以单位名义虚开发票套取50万，数额较大，情节严重，因此很有可能面临开除等严重的行政处分。

二. 刑事责任

1. 依据：如果虚开发票、套取资金的行为构成犯罪，如诈骗罪、贪污罪等，那么根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪者将可能被追究刑事责任，面临有期徒刑、罚金甚至没收财产等刑罚。
2. 应用：在此案例中，财务人员套取的资金数额达到50万，若经司法机关认定构成犯罪，那么该财务人员将可能被追究刑事责任。

综上所述，事业单位财务人员以单位名义虚开发票违规套取50万，不仅可能面临严重的行政处分，甚至有可能被追究刑事责任。我建议相关单位应加强对财务人员的监管和教育，防止此类违法行为的发生。同时，对于已经发生的违法行为，应依法严肃处理，以儆效尤。如有进一步需要，您可以继续咨询我。