工厂倒闭时，对职工的赔偿不是按底薪计算，也不是应发工资，而是依据劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来确定经济补偿金。这一规定源于《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，确保了劳动者的合法权益得到合理保障。
具体法律规定与解释：
计算基础：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为每满一年支付一个月工资的标准。
- 对于工作时间六个月以上但不满一年的，也按一年计算；而对于工作时间不满六个月的，则向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
月工资的定义：
- 这里的“月工资”是一个综合性的收入概念，包括了劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，具体包含基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，但通常不包括加班工资等非常规性收入。
- 如果劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，那么经济补偿金将按照当地最低工资标准来计算。
- 对于工作不满12个月的劳动者，其经济补偿金将按照实际工作的月数来计算平均工资。
结论重申：
因此，工厂倒闭时的职工赔偿并不是简单地按照底薪或应发工资来计算，而是基于劳动者的实际工作年限和平均工资（包含基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入，不含加班工资等非常规性收入）来确定。这一规定旨在确保劳动者的合法权益得到合理且充分的保障。如果工厂倒闭，工人一般能拿到补偿，且该补偿在破产清算时属于优先清偿范围。