当事人的物品因他人非法经营罪已被法院没收，并不免除其可能面临的行政处罚。具体分析如下：

1. 非法经营罪的刑事处罚与行政处罚并存性：

   • 非法经营罪是违反国家规定，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或其他限制买卖的物品，以及从事其他非法经营活动，扰乱市场秩序，情节严重的行为。此行为在构成犯罪并受到刑事处罚（如有期徒刑、罚金、没收财产等）的同时，并不排除行政机关依法对其追加行政处罚的可能性。
   • 行政处罚是行政机关对违反行政管理秩序的行为所实施的一种惩罚措施，如罚款、责令停业整顿、吊销许可证等。在非法经营行为中，即使行为人已受到刑事处罚，行政机关仍可根据相关行政法规对其进行行政处罚，以维护市场秩序和行政管理秩序。

2. 法律依据：

   • 《中华人民共和国刑法》第二百二十五条明确规定了非法经营罪的刑事责任。
   • 《中华人民共和国行政处罚法》则规定了行政机关对违反行政管理秩序的行为进行处罚的权力。
   • 相关司法解释也明确了行政处理与刑事处理的衔接问题，指出在追究刑事责任的同时，不排除行政机关依法给予行政处罚的权力。

3. 实际情况分析：

   • 在非法经营案件的查处过程中，行政机关往往会在初期介入，对无证经营等轻微违法行为进行查处，并依法作出行政处罚。若行为构成犯罪，则会移送司法机关追究刑事责任。
   • 即使当事人的物品因非法经营罪已被法院没收，这仅是对其犯罪行为的刑事处罚之一，并不免除其可能因违反行政管理秩序而面临的行政处罚。

综上所述，当事人的物品因他人非法经营罪已被法院没收，并不意味着其已完全免除了所有法律责任。根据具体情况，行政机关仍可能依法对其追加行政处罚。因此，建议当事人在面临此类问题时，应积极配合行政机关的调查处理，并咨询专业律师以了解自身的法律责任和应对策略。