采购人、采购代理机构不得拒收质疑供应商在法定质疑期内发出的质疑函，即使该质疑函不合规。

一. 法律依据

根据《政府采购质疑和投诉办法》（财政部令第94号）第十三条：“采购人、采购代理机构不得拒收质疑供应商在法定质疑期内发出的质疑函，应当在收到质疑函后7个工作日内作出答复，并以书面形式通知质疑供应商和其他有关供应商。”

二. 不合规质疑函的处理

1. 审查与告知

   • 采购人、采购代理机构收到不合规的质疑函后，应依法进行审查。
   • 发现质疑函不符合相关规定的，应告知供应商在一定期限内（如两个工作日）修改和补正。

2. 补正要求

   • 在告知的同时，可以附上财政部公布的《质疑函》范本，要求供应商按照范本来写作质疑函。

3. 供应商拒绝修改和补正的处理

   • 如果供应商拒绝修改和补正，采购人、采购代理机构可以书面告知其质疑为无效质疑，依法无法答复。
   • 或者，根据94号令第十六条的规定，认定该质疑不合法，答复为质疑不成立。

三. 特殊情况

1. 质疑供应商不符合条件

   • 如果提出质疑的供应商不符合94号令第十一条关于“质疑供应商”的规定，或者质疑函未在法定期限内发出，则这些质疑函可以拒收。

2. 采购代理机构的权限

   • 采购人未在委托授权范围内授权代理机构答复的质疑事项，采购代理机构应书面告知质疑供应商向采购人提出质疑，采购代理机构无权答复。

四. 法律责任

1. 拒收质疑函的法律责任

   • 根据94号令第三十六条，采购人、采购代理机构拒收质疑供应商在法定质疑期内发出的质疑函，由财政部门责令限期改正；情节严重的，给予警告，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，由其行政主管部门或者有关机关给予处分，并予通报。

我的观点：采购人、采购代理机构在处理质疑函时，应严格遵守相关法律法规，确保公正、公平、高效地处理质疑事项。对于不合规的质疑函，应通过合法合规的方式进行处理，而不是简单地拒收。