在已经就同一笔款项以民间借贷为由起诉并获得法院判决后，再次以合伙纠纷为由起诉，法院通常不会采纳，因为这可能涉及重复诉讼的问题。具体分析如下：

一. 重复诉讼问题

1. 一事不再理原则：在民事诉讼中，法院遵循“一事不再理”的原则。这意味着，如果一项争议已经由法院作出判决，并且该判决已经生效，那么当事人就不能再次就同一争议向法院提起诉讼。这是为了维护司法的权威性和稳定性，防止当事人通过反复诉讼来拖延时间或浪费司法资源。
2. 同一笔款项的争议：在您的问题中，原本是合伙做工程的款项，但已经以民间借贷为由向法院起诉并获得了判决。这意味着，就这笔款项而言，法院已经作出了处理。如果再次以合伙纠纷为由起诉，实质上是在就同一笔款项提出新的争议，这很可能被法院视为重复诉讼而不予受理。

二. 法院不采纳的原因

1. 浪费司法资源：法院需要处理大量的案件，如果允许当事人就同一争议反复起诉，将会极大地浪费司法资源，降低司法效率。
2. 维护判决的权威性：一旦法院作出判决，该判决就具有法律效力，必须履行。如果允许当事人就同一争议再次起诉，将会损害判决的权威性和稳定性，导致法律秩序的混乱。

三. 建议

• 尊重判决：既然已经以民间借贷为由起诉并获得了判决，就应该尊重并履行该判决。如果认为判决有误或存在其他问题，可以通过上诉或申请再审等合法途径来寻求救济。
• 寻求其他解决方式：如果合伙纠纷确实存在且未能得到解决，可以考虑通过协商、调解或其他非诉讼方式来解决争议。

我建议您仔细考虑是否确实存在新的争议点或证据，以及是否有必要再次起诉。如果确实需要进一步的法律帮助，可以咨询我，我们将一起探讨更合适的解决方案。