在大小周工作制下，周六是否按加班工资算，需根据具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：
标准工时制下的情况：
- 在标准工时制下，劳动者通常每周工作五天，每天八小时，总计不超过四十四小时。若实行大小周工作制，大周的周六工作将超出法定工作时间，因此应认定为加班，用人单位需支付加班工资，通常为正常工资的2倍。
特殊工时制下的情况：
- 不定时工作制：对于实行不定时工作制的劳动者，其工作时间不受固定限制，因此在大小周的周六工作一般不视为加班，用人单位无需支付加班工资。
- 综合计算工时工作制：在此制度下，以特定周期（如周、月、季、年）综合计算工作时间。只要平均日工作时间和平均周工作时间与法定标准相符，即使在大小周的周六工作也不算加班。但若周期内总工作时间超过法定标准，超出部分应视为加班并支付加班工资。
合同约定及工作性质的影响：
- 如果劳动合同中明确约定周六为正常工作时间，且单位已支付相应报酬，则周六工作不被视为加班。反之，若无此类约定或未支付额外报酬，周六工作应被视为加班。
- 某些特定行业或岗位可能因工作性质需要而在周六工作，但这并不自动构成加班。关键在于劳动合同中的约定以及实际支付的工资是否包含了周六工作的报酬。
综上所述，大小周的周六是否算加班，需根据具体的工时制度、劳动合同约定以及工作性质来综合判断。若周六工作被认定为加班，用人单位应按照《中华人民共和国劳动法》的相关规定支付加班工资。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。