合同约定增加工程量甲方在业主结算后再给乙方结算，这一约定是否合法，取决于合同的具体内容和相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同自由原则：

   • 根据《民法典》的规定，合同是当事人之间设立、变更、终止民事法律关系的协议，依法成立的合同受法律保护。
   • 合同双方有权在平等、自愿的基础上，通过协商一致的方式约定合同的内容，包括工程款的支付时间和方式。

2. 合同约定与法律法规的关系：

   • 如果合同中的约定不违反法律法规的强制性规定，不损害社会公共利益，且不存在欺诈、胁迫等无效情形，那么该约定就是合法的。
   • 在本问题中，“增加工程量甲方在业主结算后再给乙方结算”的约定，只要双方同意并签字确认，且没有违反相关法律法规，就是合法的。

3. 实际履行中的风险与应对：

   • 虽然合同约定是合法的，但在实际履行中可能会存在风险。例如，如果甲方与业主之间的结算时间很长，或者甲方故意拖延与业主的结算，那么乙方可能会面临长时间无法收到工程款的风险。
   • 为了规避这种风险，乙方可以在合同中约定明确的结算时间节点和违约责任，以确保自己的合法权益得到保障。

4. 建议与总结：

   • 在签订合同时，双方应充分协商并明确约定工程款的支付时间和方式，以确保合同的顺利履行。
   • 如果乙方对合同中的约定存在疑虑或担忧，可以寻求专业律师的帮助进行审查和修改。
   • 总的来说，合同约定增加工程量甲方在业主结算后再给乙方结算是否合法，取决于合同的具体内容和相关法律法规的规定。只要双方同意并签字确认，且没有违反相关法律法规，就是合法的。但在实际履行中仍需注意风险防范和应对措施。

综上所述，合同约定增加工程量甲方在业主结算后再给乙方结算是合法的，但双方应充分协商并明确约定相关条款，以确保合同的顺利履行和双方权益的保障。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的解答，可以直接向我咨询。