签订了实习协议，档案一般不能转入公司。下面我将从几个方面详细解释这个问题：

1. 实习协议的性质：

   • 实习协议通常是为了明确实习生与实习单位之间的权利义务关系而签订的，它并不等同于正式的劳动合同。
   • 实习生在实习期间，其身份往往还是学生，并未与实习单位建立正式的劳动关系。

2. 档案的管理规定：

   • 档案通常是由个人所在学校或户籍所在地的人事部门管理的，用于记录个人的学习、工作经历等重要信息。
   • 在未与实习单位建立正式劳动关系的情况下，实习生的档案一般不会转入实习单位进行管理。

3. 实习期间的档案管理：

   • 实习期间，实习生的档案可能仍留在学校或户籍所在地的人事部门，由他们继续管理。
   • 实习单位可能会要求实习生提供某些档案材料的复印件或证明，但并不会接收和管理实习生的全部档案。

4. 特殊情况：

   • 当然，也存在一些特殊情况。比如，某些实习单位可能与学校或人事部门有特殊的合作关系，或者实习生在实习期间表现特别优秀，实习单位有意与其建立正式的劳动关系，并愿意接收其档案。但这种情况并不常见，且需要满足一定的条件和程序。

综上所述，签订了实习协议并不意味着档案就能转入公司。实习生的档案通常仍由学校或户籍所在地的人事部门管理，直到实习生与实习单位建立正式的劳动关系，或者按照相关规定和程序办理档案转移手续。如果你对此有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。