合同约定向双方各自所在法院申诉是无效的。具体分析如下：

一. 合同约定管辖法院的原则

• 合同约定管辖法院时，应遵守《民事诉讼法》的相关规定，即合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反级别管辖和专属管辖的规定。

二. 双方各自所在法院申诉的约定效力

• 约定向双方各自所在法院申诉，实际上是在合同中约定了两个以上的管辖法院，这违反了《民事诉讼法》中关于管辖协议应明确、单一的原则。
• 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》，管辖协议约定两个以上与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，原告可以向其中一个人民法院起诉，但并不意味着双方可以各自向所在地法院申诉。
• 如果双方同时向各自所在地法院提起诉讼，将可能导致管辖冲突，不利于案件的审理和执行。

三. 实际操作的建议

• 在签订合同时，应明确约定一个具体的管辖法院，以避免管辖争议。
• 如果已经签订了包含双方各自所在法院申诉条款的合同，建议双方协商修改管辖条款，或者通过其他方式明确管辖法院。

我建议，在合同中约定管辖法院时，应严格遵守《民事诉讼法》的相关规定，确保管辖条款的明确性和有效性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。