出租人与承租人存在合同纠纷时，出租人不能直接让次承租人搬离。下面我将从几个方面详细分析这个问题：
一、合同关系的独立性
承租人与次承租人的合同：根据《中华人民共和国合同法》第二百二十四条，承租人经出租人同意，可以将租赁物转租给第三人。此时，承租人与次承租人之间的租赁合同是合法有效的，独立于出租人与承租人之间的原租赁合同。
合同相对性原则：基于合同的相对性原则，出租人与承租人之间的合同纠纷，原则上不影响承租人与次承租人之间的合同关系。因此，出租人不能直接依据与承租人的合同纠纷要求次承租人搬离。
二、出租人的权利行使
合同解除权：若出租人因承租人违约（如拖欠房租）而要求解除租赁合同，需通过法律程序进行。在合同解除后，出租人基于物权高于债权的优先性，有权要求次承租人搬离。但这一权利的行使前提是租赁合同已被合法解除。
次承租人的抗辩权：根据《最高人民法院关于审理城镇房屋租赁合同纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》第十七条，如果次承租人愿意代承租人支付欠付的租金和违约金，以抗辩出租人的合同解除权，人民法院应予支持。这意味着，在次承租人履行了相应义务的情况下，其有权继续居住，出租人无权要求其搬离。
三、建议与总结
建议：出租人在与承租人存在合同纠纷时，应首先通过法律途径解决与承租人的纠纷，如协商、调解或诉讼等。在合同解除或取得法律判决后，再根据具体情况决定是否要求次承租人搬离。
总结：出租人与承租人存在合同纠纷时，不能直接让次承租人搬离。出租人应尊重承租人与次承租人之间的合同关系，并遵循法律程序和合同约定来处理相关纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。