在劳务合同案件中，如果被告主张扣除税费，需要首先审查合同中是否有关于税费扣除的明确约定，并核实税费扣除的合法性和合理性。以下是对此问题的详细分析：

一. 审查合同约定

1. 明确约定：首先，应仔细审查劳务合同中是否明确约定了税费扣除的相关条款。如果合同中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么被告主张扣除税费通常有合同依据。
2. 约定不明或未约定：如果合同中对税费扣除没有约定或约定不明确，那么被告主张扣除税费则缺乏合同基础，原告有权对此提出异议。

二. 核实税费扣除的合法性和合理性

1. 合法性：需要核实被告主张扣除的税费是否符合国家税收法律法规的规定。例如，如果被告主张扣除的是个人所得税，那么需要确认该税费是否确实由原告承担，并且扣除的金额、方式等是否符合税法规定。
2. 合理性：除了合法性外，还需要考虑税费扣除的合理性。例如，如果被告主张扣除的税费金额过高，或者扣除方式不合理，那么原告有权要求被告提供详细的税费计算依据和扣除明细，以核实税费扣除的合理性。

三. 处理建议

1. 合同有约定且合法合理：如果合同中有明确约定，且税费扣除合法合理，那么原告应尊重合同约定，接受税费扣除。
2. 合同无约定或约定不明：如果合同中对税费扣除没有约定或约定不明确，原告可以拒绝被告的税费扣除主张，并要求被告提供税费扣除的合法依据。
3. 税费扣除不合法或不合理：如果被告主张的税费扣除不合法或不合理，原告可以向有关部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。

我建议，在处理此类案件时，双方应首先通过友好协商解决争议。如果协商不成，原告可以依法向法院提起诉讼，请求法院对税费扣除的合法性和合理性进行审查，并作出公正判决。如有进一步需要，您可以继续咨询我。