商品房旁边有化粪池是否合法，需根据具体情况来判断。

首先，从法律法规的角度来看，并没有明确规定商品房旁边不能建有化粪池。但是，这并不意味着化粪池的存在就是完全合法的，因为其还需要满足一系列的环境保护、城市规划、建筑规范等要求。

1. 环境保护要求：化粪池的建设和运营需要符合环保标准，不能对周边环境造成污染。如果化粪池的处理能力不足，或者存在泄漏、溢流等问题，就可能导致污水、臭气等污染物扩散，影响周边居民的生活质量。

2. 城市规划要求：在城市规划中，对于化粪池等基础设施的布局和建设有明确的规划要求。如果化粪池的建设位置与城市规划不符，或者未经规划部门批准就擅自建设，就可能构成违法建设。

3. 建筑规范要求：化粪池的建设还需要符合建筑规范的要求，包括结构设计、材料选择、施工工艺等方面。如果化粪池的建设不符合规范，就可能存在安全隐患，对周边居民的人身安全构成威胁。

因此，要判断商品房旁边有化粪池是否合法，需要综合考虑以上因素。如果化粪池的建设和运营符合环保、城市规划、建筑规范等要求，且没有侵犯周边居民的合法权益，那么其存在就是合法的。反之，如果存在违法违规情况，就需要依法进行整改或拆除。

如果你对商品房旁边的化粪池存在疑虑或担忧，建议向当地环保、规划、建设等部门咨询或举报，以获取更具体的法律意见和解决方案。