在高标准农田建设中，如果发现古墓，应该采取以下措施：

首先，要立即停止施工，并确保现场安全。施工人员应第一时间拨打报警电话，通知当地警方和文物管理部门。警方会迅速到达现场，拉设警戒线，对施工现场进行保护，防止文物被破坏或盗掘。

接着，文物管理所的执法人员以及考古专家会尽快赶到现场。他们会进行初步的现场勘查，判断古墓的年代、类型以及可能的文化价值。如果初步判断认为该古墓具有重要的历史、科学和艺术价值，会立即上报给上级文物部门，并申请进行进一步的考古发掘。

在考古发掘过程中，考古专家会遵循相关的考古规范和程序，对古墓进行细致的发掘和清理。他们会小心翼翼地提取出土文物，并进行详细的记录和分类。同时，还会对古墓的结构、布局以及墓葬习俗等进行深入研究，以揭示其背后的历史信息和文化内涵。

发掘工作结束后，所有出土的文物都会被安全地转移至当地的博物馆或其他文物保管机构。这些文物会按照文物考古的相关规定进行妥善保管和展示，供公众参观和学习。

此外，为了避免类似情况再次发生，政府和相关部门应加强高标准农田建设中的文物保护工作。在规划实施高标准农田建设项目前，应主动与文物部门沟通，将项目纳入到配合基本建设考古的范畴中。同时，还应加强文物保护法的宣传教育工作，提高群众的文物保护意识，共同守护好我们的历史文化遗产。

总的来说，高标准农田建设中发现古墓是一件非常严肃的事情，需要各方共同努力，确保文物的安全和保护工作的顺利进行。