核心结论：若农田被他人用作墓地，您有权要求对方停止侵害、恢复原状，并可依法主张赔偿；若涉及土地权属争议，需先通过行政或司法途径确认权属后再主张权利。以下分情况说明：

1. 若您是农田的合法使用权人（如承包经营权人）

• 法律依据：根据《土地管理法》第三十七条，禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石等破坏种植条件的行为。若对方未经您同意占用农田建墓，属于违法行为。
• 处理方式：
  • 协商解决：要求对方立即停止侵害，恢复土地原状（如移除墓碑、填平墓穴），并赔偿因占用土地导致的损失（如农作物减产、土地复垦费用等）。
  • 行政投诉：若协商无果，可向当地自然资源部门（原国土资源局）或农业农村部门举报，要求行政机关责令对方整改并处罚。
  • 民事诉讼：若损失较大或对方拒不配合，可向法院提起民事诉讼，主张停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

2. 若农田权属存在争议（如您与他人对土地使用权有争议）

• 法律依据：根据《土地管理法》第十四条，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。对处理决定不服的，可向法院起诉。
• 处理方式：
  • 权属确认：先通过协商或行政途径（如申请政府确权）明确土地使用权归属。若确认您享有使用权，再按上述第1点主张权利。
  • 谨慎处理：在权属争议解决前，避免自行采取强制措施（如破坏墓地），否则可能涉嫌侵权或违反治安管理规定。

3. 若对方占用的是集体所有但未明确承包的农田

• 法律依据：集体土地需由集体经济组织或村民委员会统一管理，未经批准擅自占用属于违法行为。
• 处理方式：
  • 向集体反映：要求集体经济组织或村委会出面制止，并协调恢复土地用途。
  • 行政举报：向自然资源部门举报，要求查处非法占用土地行为。

4. 特殊情形：若涉及历史遗留墓地或地方习俗

• 处理原则：若墓地形成于您取得土地使用权之前，或因地方习俗长期存在，需结合实际情况协商解决。可要求对方补偿土地占用费用，或通过土地置换等方式平衡利益。
• 注意事项：避免激化矛盾，建议通过村委会或基层调解组织介入协调。

建议：处理此类问题时，务必保留证据（如土地权属证明、现场照片、协商记录等），并优先通过协商或行政途径解决。若涉及复杂法律问题，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供详细方案。