当您的耕地被别人盖了坟时，这确实是一个需要妥善处理的问题。以下是一些详细的建议，希望能帮助您解决这一困境。

首先，您需要明确的是，未经合法授权，任何机构或个人都不能私自修建坟墓在耕地上。这是违反我国相关法律法规的行为，包括《中华人民共和国土地管理法》等。因此，您有权要求侵占方归还土地，恢复土地原貌，并赔偿因此造成的经济损失。

接下来，您可以按照以下步骤进行处理：

1. 调查核实与取证：

   • 组织相关部门或专业人员对耕地被占用为坟墓的情况进行详细调查，明确占用面积、位置、时间以及侵占方的具体信息等。
   • 收集相关证据，如照片、视频、证人证言等，以备后续处理使用。

2. 与侵占方协商：

   • 尝试与侵占方进行友好协商，了解其需求和意见，看是否能够达成双方都能接受的解决方案。
   • 在协商过程中，您可以提出将坟墓迁移至合法的公墓或骨灰堂等地的建议，或者探讨其他符合当地习俗和规定的处理方式。

3. 寻求法律途径：

   • 如果协商无果，您可以向当地村民委员会、乡（镇）人民政府等相关部门进行反映，请求他们进行调解或处理。
   • 若调解仍无法解决问题，您可以向农村土地承包仲裁机构提出仲裁申请，或者直接向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

4. 恢复耕地原状：

   • 在坟墓迁移或处理后，您需要及时组织力量对被占用的耕地进行复垦和整理，恢复其耕作条件。
   • 可以邀请农业专家进行指导，确保复垦后的耕地能够正常用于农业生产。

5. 加强监管与预防：

   • 建立健全土地监管机制，加强对耕地的日常巡查和监管力度，及时发现和处理非法占用耕地的问题。
   • 加强宣传教育，提高公众对耕地保护和殡葬改革的认识和支持度，减少类似问题的再次发生。

总之，处理耕地被别人盖了坟的问题需要您依法依规、保护耕地、尊重习俗、维护社会稳定的原则下进行。通过调查核实、与侵占方协商、寻求法律途径、恢复耕地原状以及加强监管与预防等措施，您可以有效地解决这一问题并维护自己的合法权益。