当判决与调解书发生冲突时，应优先执行法院判决，同时可以考虑调解协议的补充作用，并采取协商、申请司法确认或寻求法律救济等措施解决冲突。具体分析如下：
一. 理解判决与调解书的法律效力
- 调解书的法律效力：根据《人民调解委员会组织条例》第九条，人民调解委员会主持下达成的调解协议，当事人应当履行。这表明调解协议具有一定的法律约束力。
- 判决的法律效力：法院判决是司法机关对案件作出的具有法律强制力的决定，当事人必须履行。判决一旦生效，即具有既判力，非经法定程序不得变更或撤销。
二. 处理判决与调解书冲突的原则
- 优先执行法院判决：由于法院判决具有更高的法律效力，当调解协议与法院判决发生冲突时，原则上应优先执行法院判决。
- 调解协议的补充作用：如果调解协议的内容与法院判决不冲突，且有助于更好地实现法院判决的目的，当事人可以在履行法院判决的基础上，自愿履行调解协议的相关内容。
三. 解决冲突的具体措施
- 协商解决：当事人可以在尊重法院判决的前提下，就调解协议与判决冲突的部分进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 申请司法确认：如果当事人对调解协议的法律效力有异议，可以向人民法院申请司法确认。经法院确认有效的调解协议，具有与法院判决同等的法律效力。
- 寻求法律救济：如果当事人认为法院判决存在错误或与调解协议存在严重冲突，可以依法提起上诉或申请再审，通过法律途径解决冲突。
例如，如果某案件中，法院判决要求被告支付原告一定金额的赔偿，而之前双方曾达成调解协议，协议中的赔偿金额与法院判决不一致。在这种情况下，被告应优先按照法院判决的金额进行支付。如果调解协议中有其他有助于双方和解的内容，且不与法院判决相冲突，双方仍可以自愿履行。如果双方对调解协议的法律效力有争议，或认为法院判决存在错误，可以通过上述措施寻求解决。
综上所述，在处理判决与调解书冲突时，应明确两者的法律效力及相互关系，并遵循优先执行法院判决的原则，同时考虑调解协议的补充作用。如无法协商解决冲突，当事人可以通过法律途径寻求救济。如有进一步需要，您可以继续咨询我。