公司收取标书制作费是否合法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

一. 如果公司具有相应的资质，并且双方有明确的约定，那么收取标书制作费是合法的

1. 资质问题：公司需要具备提供标书制作服务的相应资质。例如，如果公司是一家专业的咨询机构或招标代理机构，并且具有相关的营业执照和经营范围，那么它就有资格提供标书制作服务，并据此收取费用。
2. 双方约定：根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，当事人双方可以自愿订立合同，并约定合同的内容。因此，如果公司和客户在合同中明确约定了标书制作费，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么收取这笔费用就是合法的。

• 例如，某公司是一家专业的招标代理机构，它与一家企业签订了招标代理合同，合同中明确约定了标书制作费。在这种情况下，公司收取标书制作费是合法的，因为它具有相应的资质，并且双方有明确的约定。

二. 如果公司没有相应资质或双方没有明确约定，那么收取标书制作费可能是违法的

1. 无资质问题：如果公司没有提供标书制作服务的相应资质，却擅自收取费用，那么这种行为就可能构成违法经营。
2. 无约定或约定不明：如果双方没有签订书面合同，或者合同中未明确约定标书制作费，那么公司单方面收取这笔费用就可能构成不当得利，违反《中华人民共和国民法总则》的相关规定。

• 例如，某公司并非专业的招标代理机构，也没有相关的营业执照和经营范围，却擅自向一家企业收取标书制作费。在这种情况下，公司的行为就可能构成违法经营，因为它没有相应的资质。

综上所述，公司收取标书制作费的合法性取决于其是否具有相应资质以及双方是否有明确的约定。我建议公司在收取费用前，务必确保自己具备相关资质，并与客户签订明确的合同，以避免法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。