虚开增值税专用发票补缴税款后，依然可能继续追究刑事责任。但补缴税款等悔罪行为在量刑时会作为从轻情节予以考虑。

法律认定与条款

根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条的规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票，是严重的违法行为，一旦实施即构成犯罪。该罪行属于行为犯，即只要实施了虚开行为，无论后续是否补缴税款，都构成了犯罪。具体量刑标准依据虚开的税款数额及情节严重程度分为三档，包括有期徒刑、拘役及罚金等。

补缴税款的影响与量刑考量

1. 不影响定罪：补缴税款并不能消除已经实施的犯罪行为及其社会危害性，因此不影响对虚开增值税专用发票罪的定性。即，补缴税款并不能免除刑事责任。

2. 影响量刑：补缴税款等悔罪行为在量刑时会被视为一个重要的从轻情节予以考虑。法院会综合考虑各种因素，包括是否主动补交税款、补缴滞纳金、缴纳罚款，以及如实供述自己罪行、认罪认罚等情节，这些通常可以作为从轻处罚的依据。

实际案例分析

在实际案例中，即使犯罪嫌疑人或被告人在侦查后补交了税款，也仍然被追究了刑事责任。但考虑到其补交税款和悔罪表现，法院在量刑时给予了适当的从轻处理。

法律建议

1. 严格遵守税法：企业和个人应严格遵守税法规定，确保所有发票的真实性和合法性，避免陷入虚开增值税专用发票的法律风险。

2. 及时补救措施：对于已经发生的虚开行为，应尽快采取措施补救，如主动补交税款、配合调查等，以减轻可能的法律责任。但需注意，这些补救措施并不能替代对犯罪行为的制裁。

3. 咨询专业意见：在处理涉及虚开增值税专用发票的问题时，建议咨询专业的法律人士，以便得到更准确的解答和更有针对性的法律建议。

综上所述，虚开增值税专用发票是严重的违法行为，将面临严厉的法律处罚。即使侦查后补交了税款，也不能免除刑事责任，但补交行为可以作为量刑时的一个重要从轻情节予以考虑。因此，企业和个人应时刻保持警惕，确保税务合规。