针对您提出的“虚开发票罪在补缴税额后怎么处理”的问题，这是一个涉及税务和法律两个层面的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、立即停止违法行为并主动报告

一旦发现存在虚开发票的行为，首要步骤是立即停止相关活动，避免进一步违法。紧接着，您应尽快与主管税务机关取得联系，说明情况，并表达积极配合调查的态度。按照税务机关的要求，如实提供相关账簿、凭证、合同等资料，以便税务机关核实情况。

二、配合税务机关的调查和处理

在税务机关进行调查时，您需要：

1. 接受询问：配合税务机关的询问，如实陈述事实，不得隐瞒或谎报。
2. 提供证据：根据税务机关的要求，提供必要的证据材料，协助税务机关查明事实真相。
3. 执行处罚决定：如果税务机关认定存在虚开发票行为，您应依法接受处罚，这包括补缴税款、滞纳金和可能的罚款等。

三、补缴税款及滞纳金

补缴税款是纳税人应尽的义务。您需要按照税务机关核定的税额和滞纳金金额，通过银行转账等方式及时足额缴纳。在补缴过程中，请确保金额准确无误，并保留好补缴凭证，以备后续查询和审计。

四、补缴税款后的法律后果

补缴税款并不免除刑事责任。虚开发票可能构成犯罪，如虚开增值税专用发票罪等，即使补缴了税款，仍可能面临刑事处罚。不过，在司法实践中，法院在量刑时会综合考虑被告人的各种情节，包括是否主动补缴税款、补缴的及时性、补缴的金额等。如果您能够积极补缴税款并表现出悔罪态度，这通常会被视为从轻或减轻处罚的情节之一。

五、可能的判刑情况

1. 一般情况下：根据刑法规定，虚开发票罪的最高刑期可达无期徒刑，并处罚金或没收财产。具体刑期和罚金数额由法院根据案件的具体情况确定，包括虚开的金额、数量、造成的国家税款损失程度以及被告人的主观恶性等因素。
2. 补缴税款后的从轻或减轻处罚：如果您能够积极补缴税款并表现出悔罪态度，法院在量刑时可能会给予一定的从轻或减轻处罚。但这种从轻或减轻处罚并非绝对，而是取决于案件的具体情况和法院的裁量权。
3. 其他可能影响判刑的因素：除了补缴税款外，法院还会考虑您是否有自首、立功等其他从轻或减轻处罚的情节。同时，您的前科记录、犯罪手段、社会影响等因素也可能对判刑产生影响。

六、加强内部管理和合规建设

为了避免类似问题的再次发生，您需要加强内部管理和合规建设：

1. 完善财务制度：建立健全财务管理制度，加强对发票开具、使用等环节的管理和监督。
2. 提高员工素质：加强对员工的培训和教育，提高其法律意识和合规意识。
3. 定期自查自纠：定期开展自查自纠工作，及时发现和纠正存在的问题，防范税务风险。

七、寻求专业帮助

如果您对税务处理流程不熟悉或存在疑问，可以咨询专业的税务律师或会计师。他们可以提供具体的法律意见和操作指导，帮助您更好地应对税务问题。

综上所述，虚开发票罪在补缴税额后仍可能面临刑事处罚，但补缴税款和表现出悔罪态度可能会作为从轻或减轻处罚的情节考虑。为了避免类似问题的再次发生，您需要加强内部管理和合规建设，并在必要时寻求专业帮助。