旷工半天按三天算通常是不合法的。下面我将从几个角度详细解释这个问题：

1. 法律规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
   • 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求赔偿，但从工资中扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

2. 合理性分析：

   • 旷工半天仅表示劳动者在当天有部分时间未提供劳动，用人单位最多只能不支付或合理扣除与旷工时间相对应的工资部分。
   • 直接按三天计算并扣除工资，明显超出了合理范围，也违反了法律规定中关于工资支付和扣除的限额。

3. 公司规章制度：

   • 虽然用人单位有权制定自己的规章制度来管理员工，但这些规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并向劳动者公示告知。
   • 如果公司规章制度中规定了旷工半天按三天算这样的条款，但该条款未经合法程序制定或内容不合理，那么该条款对劳动者不具有法律效力。

4. 劳动者权益保护：

   • 劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位无故克扣工资是侵害劳动者权益的行为。
   • 如果劳动者认为用人单位的扣除方式不合法或不合理，可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，旷工半天按三天算通常是不合法的，因为它违反了法律规定中关于工资支付和扣除的限额，也侵害了劳动者的合法权益。如果你遇到了这样的情况，可以与用人单位沟通协商，要求其按照法律规定支付工资；如果协商不成，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维权。