当单位垫付了工伤费用后，理赔所得的处理方式主要依据实际情况和法律规定来确定。以下是一个清晰、详细且有深度的解答：
一、已缴纳工伤保险的情况
费用偿还：
- 如果单位已经为职工缴纳了工伤保险，并且垫付了医疗费用等，当从工伤保险基金获得相应支付时，单位有权要求将这部分垫付的费用偿还给自己。例如，社保部门支付了工伤职工的医疗费后，这笔费用就应该返还给垫付的单位。
报销流程：
- 单位需要准备好相关垫付凭证、工伤认定决定书、医疗费用清单等材料，然后向社保经办机构申请报销垫付的费用。这样做可以确保单位垫付的资金得到合理回笼。
停工留薪期工资处理：
- 单位支付给工伤职工的停工留薪期工资，如果职工最终被认定为工伤，这部分费用无需退还。
二、未缴纳工伤保险的情况
费用支付：
- 如果单位未给职工缴纳工伤保险，那么职工发生工伤后，单位需要按照《工伤保险条例》规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用。此时，单位垫付的赔偿就等同于履行了支付义务。
证据留存：
- 在未缴纳工伤保险的情况下，单位垫付赔偿后一定要留存好相关支付凭证等证据，以备后续可能出现的问题。
三、协商与争议解决
协商一致：
- 如果职工和单位就工伤赔偿事宜达成一致，单位垫付的费用可以按照协商结果处理。例如，双方可以约定垫付的费用在后续赔偿款中进行抵扣。
协商不成：
- 如果双方协商不成，职工可以通过劳动仲裁等法律途径来解决争议。在仲裁或诉讼过程中，会根据工伤认定和劳动能力鉴定结果来确定单位垫付费用最终由谁承担。
四、特殊情况处理
- 如果发现职工存在骗保等不应享受工伤待遇的情况，单位可以先尝试与职工协商，要求其返还垫付费用；如果协商不成，则可以通过诉讼方式来维护自身权益。
综上所述，单位垫付工伤费用后理赔所得的处理方式需要根据实际情况和法律规定来确定。无论是已缴纳工伤保险还是未缴纳工伤保险的情况，单位都应该留存好相关证据和凭证，并确保按照法律规定来处理垫付费用。在协商不成的情况下，可以通过法律途径来解决争议。