针对您提出的“付款审批没盖章但已付款怎么办”的问题，这确实是一个涉及财务管理流程的问题。虽然您提供的参考信息主要关于外汇管理局的办事指南和银行端查询缴税费流程，这些内容与您的直接问题不完全吻合，但我可以基于一般的财务管理原则和实践，给您提供一个清晰的解答思路。

首先，我们需要明确一点：付款审批没盖章但已付款，这通常意味着在财务流程中出现了某种程度的违规或疏漏。正常情况下，付款前应该经过严格的审批流程，包括相关人员的签字盖章，以确保付款的合法性和准确性。

针对这种情况，您可以采取以下步骤来处理：

1. 立即沟通：

   • 首先，与负责付款审批的部门或人员取得联系，了解为何在未经盖章的情况下就进行了付款。
   • 同时，与财务部门沟通，确认付款的具体情况和金额，以及是否有可能追回或纠正。

2. 核查内部流程：

   • 审查公司的财务管理制度和付款流程，找出可能导致此类问题发生的漏洞或不足。
   • 检查是否有其他类似的未经审批就付款的情况，以便全面了解问题的严重性。

3. 采取补救措施：

   • 如果付款确实存在错误或不合规，应尽快与收款方协商退款或调整付款条件。
   • 如果无法追回付款，且公司内部流程存在问题，应考虑修订财务管理制度，加强付款审批和内部控制。

4. 记录并报告：

   • 将此次事件记录在案，包括发生的时间、原因、涉及的金额以及采取的补救措施。
   • 如果问题严重，应及时向公司高层或相关部门报告，以便他们了解并采取进一步的行动。

5. 预防未来类似事件：

   • 加强员工培训，提高员工对财务管理制度和付款流程的认识和遵守意识。
   • 定期对财务管理制度和付款流程进行审查和更新，以适应公司的发展和变化。

总之，处理这类问题需要迅速、果断和细致。通过及时沟通、核查内部流程、采取补救措施、记录并报告以及预防未来类似事件，您可以有效地应对付款审批没盖章但已付款的情况，并确保公司的财务管理流程更加规范和严谨。