加班费只发放基本工资是不合法的。这种行为属于拖欠劳动者工资的行为，因为加班费不应仅按照基本工资来计算，而应依据劳动者的实际收入、加班天数以及不同的节假日来综合计算。
具体分析
法律依据：
- 根据《劳动法》第四十四条，加班工资的计算应按照高于劳动者正常工作时间工资的标准来支付，具体为：延长工作时间支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日工作且不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
加班费的计算基数：
- 加班费的计算基数应按照劳动合同的约定来确定，但不得低于当地最低工资标准。如果劳动合同明确约定了工资数额，且该数额与实际发放一致，那么通常以约定的工资作为加班费的计算基数。
- 若劳动合同没有明确约定，则应按照正常出勤月工资的70%来确定，但仍需确保不低于当地最低工资标准。
基本工资与标准工资的区别：
- 基本工资只是标准工资的一部分，标准工资还包括岗位工资、职务工资等其他固定的工资项目。因此，仅以基本工资来计算加班费是不合法的，会损害劳动者的权益。
劳动者的维权途径：
- 如果劳动者认为用人单位计算加班费的方式侵害了自己的权益，可以通过向劳动保障行政部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁来维权。
- 在投诉或申请仲裁时，劳动者应提供相关的证据材料，如劳动合同、工资银行账单等，以证明自己的主张。
综上所述，加班费只发放基本工资是不合法的。用人单位应按照法律规定的标准来计算和支付加班费，以确保劳动者的合法权益得到保障。如果劳动者遇到此类问题，应及时向相关部门投诉或申请仲裁来维护自己的权益。