针对你提出的问题，关于一案存在两种以上行政违法行为应如何进行案件定性，以下是详细的分析和回答：

结论：在行政案件中，若一案存在两种以上行政违法行为，通常应依据各违法行为的性质、情节、社会危害程度等因素，分别进行定性，并依据相关法律法规的规定，分别作出相应的行政处罚决定。

分析说明：

1. 分别定性的原则：

   • 行政违法行为具有独立性，每种违法行为都应根据其自身的性质、特点进行定性。
   • 即使在一个案件中同时存在多种违法行为，也不能将其混为一谈，而应分别对待。

2. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规的规定，行政机关在查处行政违法行为时，应当对每种违法行为进行独立调查、取证，并依据相关法律规定进行定性。
   • 对于多种违法行为并存的案件，行政机关应分别作出行政处罚决定，并明确每种违法行为的性质、情节、社会危害程度以及相应的处罚措施。

3. 实践操作：

   • 在实际操作中，行政机关会针对每种违法行为制作独立的行政处罚决定书，明确列出违法事实、法律依据、处罚种类和幅度等内容。
   • 若多种违法行为之间存在关联或共同之处，行政机关在处罚时可能会考虑这一因素，但并不会改变分别定性的原则。

4. 特殊情况处理：

   • 在某些特殊情况下，如违法行为之间存在吸收关系或竞合关系，行政机关可能会根据具体情况进行合并处理或选择其中较重的违法行为进行处罚。
   • 但这种处理方式仍需遵循法律法规的规定，并确保处罚的公正性和合理性。

综上所述，对于一案存在两种以上行政违法行为的案件，应分别进行定性，并依据相关法律法规的规定分别作出行政处罚决定。这样做既能确保法律的公正实施，也能有效维护社会秩序和公共利益。如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。