针对您提出的“行政初犯小于1000元盗窃怎么处理”的问题，以下是我为您提供的清晰、详细且有深度的解答：

一、处理原则与法律依据

1. 处理原则：对于盗窃金额低于1000元的初犯，虽然未达到盗窃罪的立案标准，但仍会依据《治安管理处罚法》进行相应处理。处理时，会综合考虑盗窃的情节、手段以及嫌疑人的认罪态度等因素。

2. 法律依据：根据《治安管理处罚法》第四十九条，盗窃公私财物的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。

二、具体处理建议

1. 主动配合调查：若被公安机关发现，应主动配合调查，如实陈述情况，展现诚恳的认错态度。这有助于减轻处罚。

2. 积极争取谅解：若符合从轻处理条件，如主动退还财物、真诚道歉并赔偿损失等，应积极争取被害人的谅解。这可以进一步减轻处罚。

3. 与办案机关协商：依据《治安管理处罚法》，及时与办案机关协商，争取适用较轻处罚，如单处罚款或较短拘留期限。

三、特殊情形说明

1. 多次盗窃等特定情形：虽然单次盗窃金额低于1000元，但若存在多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃等特定情形，仍可能构成盗窃罪，面临刑事处罚。

2. 案底问题：对于盗窃金额低于1000元的初犯，若未构成犯罪，则依据《治安管理处罚法》进行处理，会有违法记录，但不算刑法意义上的案底。然而，若因特殊情形被判定为盗窃罪，则会留下刑事犯罪的案底。

综上所述，对于行政初犯小于1000元的盗窃行为，虽然未达到刑事立案标准，但仍会受到治安管理处罚。在处理时，应主动配合调查、积极争取谅解，并与办案机关协商争取轻罚。同时，也应注意特殊情形的存在，以免因疏忽而面临更严重的法律后果。